m.quanpro.cn
平當(dāng)樹基因組獲解析
平當(dāng)樹(Paradombeya sinensis)是我國西南干熱河谷特有的國家二級(jí)重點(diǎn)保護(hù)野生植物，特產(chǎn)云南省和四川省怒江、金沙江等流域，具有極強(qiáng)的耐旱能力，在生態(tài)修復(fù)和園林觀賞方面潛力突出。
近日，中國科學(xué)院昆明植物研究所云南省極小種群野生植物綜合保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究團(tuán)隊(duì)綜合運(yùn)用PacBio HiFi、Oxford Nanopore、Hi-C等多種測序技術(shù)，獲得了無間隙的染色體級(jí)別參考基因組，并解析了其葉綠體與線粒體基因組特征。此次組裝的基因組總長約890 Mb，注釋到68,639個(gè)基因，完整度高達(dá)99.93%。這一高質(zhì)量基因組將用于解決平當(dāng)樹屬與其近緣屬的分類爭議，并為保護(hù)單元?jiǎng)澐?、遷地保護(hù)效果評估、抗旱基因挖掘及生態(tài)修復(fù)示范項(xiàng)目提供重要支撐，為該物種的保護(hù)遺傳學(xué)、系統(tǒng)發(fā)育地位確立及可持續(xù)利用奠定了關(guān)鍵基礎(chǔ)。同時(shí)，平當(dāng)樹枝條優(yōu)雅、花序潔白，具備園藝開發(fā)價(jià)值，基因組資源也將推動(dòng)其優(yōu)良品種的選育與應(yīng)用。
基于本研究結(jié)果，團(tuán)隊(duì)在國際期刊Scientific Data在線發(fā)表了題為A haplotype-resolved gap-free chromosome assembly of the threatened plant Paradombeya sinensis的研究論文，團(tuán)隊(duì)博士研究生陶麗丹為第一作者，孫衛(wèi)邦研究員為通訊作者，昆明植物園唐凌云工程師以及團(tuán)隊(duì)碩士研究生陳俞熒為本文其余作者。本研究獲得云南省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目“西南山地河谷生物多樣性保護(hù)及生態(tài)屏障建設(shè)研究”(202403AC100028)和國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目“植物園遷地保護(hù)與種質(zhì)資源保存關(guān)鍵技術(shù)”課題二(2024YFF1307402)的資助。
| 版權(quán)聲明： 1.依據(jù)《服務(wù)條款》，本網(wǎng)頁發(fā)布的原創(chuàng)作品，版權(quán)歸發(fā)布者（即注冊用戶）所有；本網(wǎng)頁發(fā)布的轉(zhuǎn)載作品，由發(fā)布者按照互聯(lián)網(wǎng)精神進(jìn)行分享，遵守相關(guān)法律法規(guī)，無商業(yè)獲利行為，無版權(quán)糾紛。 2.本網(wǎng)頁是第三方信息存儲(chǔ)空間，阿酷公司是網(wǎng)絡(luò)服務(wù)提供者，服務(wù)對象為注冊用戶。該項(xiàng)服務(wù)免費(fèi)，阿酷公司不向注冊用戶收取任何費(fèi)用。 名稱：阿酷（北京）科技發(fā)展有限公司 聯(lián)系人：李女士，QQ468780427 網(wǎng)絡(luò)地址：www.arkoo.com 3.本網(wǎng)頁參與各方的所有行為，完全遵守《信息網(wǎng)絡(luò)傳播權(quán)保護(hù)條例》。如有侵權(quán)行為，請權(quán)利人通知阿酷公司，阿酷公司將根據(jù)本條例第二十二條規(guī)定刪除侵權(quán)作品。 |