首個新冠病毒刺突蛋白全原子開源模型問世

首個新冠病毒刺突蛋白全原子開源模型問世
一種刺突蛋白模型。圖片來源:物理學(xué)家組織網(wǎng)
科技日報北京6月23日電(記者劉霞)刺突蛋白在新冠病毒進入人體細胞中起關(guān)鍵作用,使其成為新冠肺炎疫苗和抗病毒藥物開發(fā)的主要靶標(biāo)。據(jù)物理學(xué)家組織網(wǎng)22日報道,一個國際科研團隊近日創(chuàng)建了首個刺突蛋白全原子開源模型,研究人員稱,科學(xué)家們可利用最新模型,針對新冠肺炎防治方法開展富有創(chuàng)新性的模擬研究,從而促進療法和疫苗的研發(fā)進度。
來自韓國國立大學(xué)、英國劍橋大學(xué)和美國理海大學(xué)的研究人員攜手開發(fā)了最新模型。研究發(fā)表于最新一期《物理化學(xué)B雜志》。
刺突蛋白是新冠病毒用來與受體結(jié)合的主要表面蛋白,當(dāng)刺突蛋白與人類細胞受體結(jié)合后,病毒膜與人類細胞膜融合,使得病毒基因組得以進入人類細胞并開始感染。
研究人員用冷凍電鏡測定了刺突蛋白的結(jié)構(gòu),但這一模型有許多丟失的氨基酸殘基。因此,他們首先對缺失的殘基進行建模,然后對其他缺失的域進行建模。此外,他們也對附著于刺突蛋白的所有潛在聚糖(或碳水化合物)進行了建模。這些聚糖會阻止抗體識別出刺突蛋白,加大疫苗研發(fā)的難度。他們還創(chuàng)建出了刺突蛋白的病毒膜系統(tǒng),用于分子動力學(xué)模擬。
里海大學(xué)生物科學(xué)和生物工程學(xué)系教授尹元弼(音)說:“我們的模型是首個完全糖基化、全鏈新冠病毒刺突蛋白開源模型,科學(xué)家可以使用我們的模型,針對新冠肺炎防治方法開展富有創(chuàng)新性的模擬研究。”
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