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最大規(guī)模人類遺傳變異體目錄公布，有助破解基因功能“密碼”
141456個外顯子組和基因組序列的匯總（圖a）。
圖片來源：《自然》網(wǎng)站
科技日報北京5月31日電 （記者張夢然）英國《自然》《自然·通訊》《自然·醫(yī)學(xué)》雜志近日同時發(fā)表來自多家研究機構(gòu)的一系列報告，集中描述了對一個匯集了逾14萬人樣本的數(shù)據(jù)庫——基因組聚集數(shù)據(jù)庫（gnomAD）的應(yīng)用，該數(shù)據(jù)庫擁有迄今最大規(guī)模的人類遺傳變異體公開目錄，是我們深入認(rèn)識人類基因功能、發(fā)現(xiàn)新疾病相關(guān)基因的寶貴資源。
人類基因組中絕大多數(shù)基因的功能依然未知。揭示基因功能的一種方法是觀察基因發(fā)生突變后的結(jié)果。這些變異體往往會產(chǎn)生不良結(jié)果，但通常較為罕見。大規(guī)?；驕y序研究有助于考察這些功能喪失型變異體的效應(yīng)，或能帶來對人類生物學(xué)特征和疾病的重要見解。
此次《自然》發(fā)表的一篇概述性報告中，美國麻省理工學(xué)院—哈佛大學(xué)博德研究所科學(xué)家康拉德·卡澤維斯基及其同事，描述了從125748個全外顯子組和15708個全基因組測序數(shù)據(jù)集中鑒定出的443769個預(yù)測的功能喪失型變異體。鑒于這些變異體預(yù)計會影響其編碼蛋白的正常運作，團隊進而評估了這些變異體對生理機能的影響：究竟是幾乎沒有影響，還是會導(dǎo)致嚴(yán)重的健康問題?！蹲匀弧吠瑫r發(fā)表的另外兩篇報告，利用該數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建了一個結(jié)構(gòu)性變異體資源庫，并評估了基因缺失、復(fù)制，甚至是顛倒方向所產(chǎn)生的影響。
同時出爐的其他報告，探討了如何利用人類功能喪失型變異體評價候選藥物靶點，提升對遺傳變異體的臨床解讀，以及如何更詳細(xì)地考察特異性功能喪失型變異體。譬如英國帝國理工學(xué)院科學(xué)家尼古拉·威芬和同事分析了與帕金森病風(fēng)險增加相關(guān)的一個基因的變異體，結(jié)果顯示靶向這個基因或是一種安全的治療方法。
科學(xué)家們表示，gnomAD項目的樣本量是其前任的兩倍多，之前的外顯子組聚集聯(lián)盟（ExAC）收錄了6萬多個外顯子組數(shù)據(jù)。卡澤維斯基與同事也指出，他們距離鑒定出人類全部的預(yù)測功能喪失型變異體還很遙遠，盡管如此，他們認(rèn)為這項資源能夠提升我們對罕見和常見遺傳病的評估。
總編輯圈點
生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的發(fā)展，已經(jīng)使科學(xué)家對很多疾病的研究直抵分子和基因?qū)用?。深入研究人類基因組，成為解鎖諸多重大疾病病因的關(guān)鍵，帕金森癥、阿爾茲海默癥、自閉癥等一系列病因復(fù)雜的疾病都在此列。除了尋找病因，對人類基因組的破譯，也可以為很多疾病的治療定位重要藥物靶點，從而為研發(fā)更有效的生物藥物、制定更精準(zhǔn)的診療方案帶來希望。
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